Исследователи из Женевского университета предложили новый способ выявления колоректального рака по образцу кала. В основе метода – анализ кишечной микрофлоры с помощью машинного обучения. По данным университета, модель смогла обнаружить 90% случаев рака, что приблизилось к показателю колоноскопии, для которой обычно указывают около 94%.

Главная идея в том, что ученые смотрели не просто на виды бактерий в кишечнике, а на их подвиды. Авторы работы считают, что именно такой уровень детализации лучше показывает, какие микробы могут быть связаны с болезнью. Для этого команда собрала подробный каталог подвидов бактерий человеческого кишечника, а затем объединила его с уже существующими клиническими данными.
На практике это может означать более простой и менее неприятный скрининг. Сейчас колоноскопия остается основным методом диагностики и подтверждения колоректального рака, но многие откладывают ее из-за дискомфорта и стоимости. Новый тест авторы рассматривают не как полную замену колоноскопии уже сейчас, а как возможный рутинный скрининг, после которого на колоноскопию будут направлять только часть пациентов с подозрительным результатом.
У работы есть и еще один важный акцент: метод пока нужно дополнительно проверять в клинике. В Женеве уже готовят первое клиническое исследование вместе с университетскими больницами, чтобы точнее понять, какие стадии рака и какие поражения такой анализ способен находить.
Результаты опубликованы в журнале Cell Host & Microbe. Авторы считают, что похожий подход позже можно будет использовать и для других болезней, если удастся найти характерные изменения микробиоты.